Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EDAQ92838 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDAQ92838 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDAQ92838 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDAQ92838 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EDAQ92838 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EDAQ92838 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EDAQ92838 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms