Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PHIPQ8WWQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PHIPQ8WWQ0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms