Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MCOLN3Q8TDD5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MCOLN3Q8TDD5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms