Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRAPPC6BQ86SZ2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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