Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LRIG3Q6UXM1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms