Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MED27Q6P2C8 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms