Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM46CQ5VWP2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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FAM46CQ5VWP2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAM46CQ5VWP2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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