Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC006547.1-209ENST00000596334 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FAM208BQ5VWN6 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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