Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FNDC1Q4ZHG4 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms