Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TTLL9Q3SXZ7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms