Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2B3Q16720 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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