Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC85BQ15834 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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