Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NPTX1Q15818 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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