Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA1Q15788 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA1Q15788 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms