Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED1Q15648 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED1Q15648 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED1Q15648 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED1Q15648 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED1Q15648 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MED1Q15648 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED1Q15648 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MED1Q15648 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MED1Q15648 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MED1Q15648 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms