Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PCOLCEQ15113 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PCOLCEQ15113 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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