Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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SHPRHQ149N8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SHPRHQ149N8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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SHPRHQ149N8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SHPRHQ149N8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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