Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMCO1Q147U7 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMCO1Q147U7 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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