Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FAM53BQ14153 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms