Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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COL9A3Q14050 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A3Q14050 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms