Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNGB1Q14028 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNGB1Q14028 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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