Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RASGRF1Q13972 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms