Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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NCOA4Q13772 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NCOA4Q13772 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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NCOA4Q13772 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NCOA4Q13772 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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