Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PEX6Q13608 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PEX6Q13608 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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