Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TUBB3Q13509 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TUBB3Q13509 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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