Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGCGQ13326 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGCGQ13326 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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