Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CLN3Q13286 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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