Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GPS1Q13098 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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