Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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TWF1Q12792 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TWF1Q12792 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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