Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms