Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SRSF4Q08170 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SRSF4Q08170 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms