Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SOX4Q06945 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms