Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PTPN11Q06124 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms