Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN12Q05209 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN12Q05209 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms