Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ZNF85Q03923 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms