Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PAXIP1-AS2-201ENST00000397551 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 DUSP19-201ENST00000342619 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC012236.1-202ENST00000558388 1024 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SOX2-OT-244ENST00000627738 692 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL031282.1-204ENST00000418950 497 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB1Q02641 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms