Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CDC42EP1Q00587 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms