Protein–RNA interactions for Protein: P78527

PRKDC, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKDCP78527 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PRKDCP78527 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PRKDCP78527 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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