Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HBBP68871 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HBBP68871 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
HBBP68871 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HBBP68871 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms