Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP1S1P61966 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms