Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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CLDN15P56746 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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