Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIRAP54198 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIRAP54198 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms