Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TTPAP49638 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TTPAP49638 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TTPAP49638 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TTPAP49638 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TTPAP49638 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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