Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ME1P48163 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ME1P48163 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ME1P48163 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ME1P48163 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms