Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RANGAP1P46060 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms