Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MLH1P40692 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MLH1P40692 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms