Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HOXD12P35452 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXD12P35452 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms