Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CCKARP32238 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCKARP32238 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCKARP32238 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms