Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXA13P31271 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms