Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-FP30511 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-FP30511 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms